為進一步推動優異的研究能力和專業教育以服務粵港澳大灣區的建設，并完善其高等教育空間布局，2020年初, 香港城市大學與東莞市政府、東莞理工學院簽署合作辦學協議，于東莞市松山湖科學城內建設具有獨立法人資格的內地與香港合作辦學機構——香港城市大學（東莞）（港城大（東莞））。港城大（東莞）位于松山湖科學城屏山東片區，莞深高速南側，依山傍水，乃是營建高等學府的理想之地。校園占地面積523畝，并預留200畝用地以支持未來發展。
港城大（東莞）將在未來的教學、研究和知識轉移等方面起領頭作用。在借鑒港城大優勢學科、國際聯系和師資的基礎上，強化兩校在學科領域內相互支撐、深度互動，滿足大灣區高等教育發展的需求并對接產業發展需求。港城大與港城大（東莞）關聯的核心是一致的學術素質，兩者將通過學術規劃、學生交流、師資培訓、研究及成果轉化緊密相連，相輔相成。符合學位授予資格的港城大（東莞）畢業生將同時獲得港城大的學位。
2024年4月16日，國家教育部向廣東省人民政府發函，批準正式設立香港城市大學（東莞）。香港城市大學（東莞）的正式設立，是貫徹落實《粵港澳大灣區發展規劃綱要》，推進粵港澳大灣區高等教育合作的重要標志性成果。
“教研合一、兩校一質、創新無限"——港城大（東莞）將以此為辦學理念，致力于將港城大先進的管理經驗、國際化的辦學理念、優秀的科研能力和創新的教學方法等世界一流優質教育資源引入內地。港城大（東莞）在前期將結合大灣區未來產業轉型升級的發展需要進行學科規劃，逐步建立一個開放式跨學科教育、研究及知識轉移的合作平臺；通過促進科技創新，培育高端人才，實現兩地優勢資源互補，為優化粵港澳大灣區高等教育布局結構、匯聚高端人才、建設綜合性國家科學中心做出積極的貢獻，逐步發展成為致力于創建卓越科研和教育的世界一流高等學府。
