安徽省農業科學院水產研究所（以下簡稱水產所）始建于1955年3月，隸屬于安徽省農業科學院，公益性一類事業單位，所址位于合肥市廬陽區農科南路40號。主要從事水產應用技術研究和應用基礎研究，重點開展水產種質資源挖掘、水產良種選育、水產動物疫病防控、池塘健康養殖、稻漁綜合種養、水產動物營養與飼料、大水面生態漁業、水生生物資源監測等學科和領域的技術研究。內設水產動物遺傳育種研究室、水產動物養殖研究室、水產動物病害研究室、水環境研究室和辦公室。依托該所建有國家大宗淡水魚產業技術體系合肥綜合試驗站、國家蝦蟹產業技術體系合肥綜合試驗站、國家特色淡水魚產業技術體系合肥綜合試驗站、農業農村部長江流域水生生物資源監測安徽站、安徽省水產產業技術體系、水產增養殖安徽省重點實驗室、安徽省特種水產養殖示范性國際科技合作基地、安徽省水產良種選育和健康養殖“115”產業創新團隊等，為國家漁業科技創新聯盟成員單位、安徽省水產學會副理事長單位。全所現有在職職工52人，其中高級職稱22人，博士20人，安徽省學術和技術帶頭人1人，享受國務院特殊津貼專家2人，安徽省政府特殊津貼專家2人。擁有實驗室面積1500m2,儀器設備400多臺（套），試驗基地面積10ha，科研輔助用房2100m2，實驗、試驗條件滿足研發所需。